Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y7

SDR16C5, Epidermal retinol dehydrogenase 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR16C5Q8N3Y7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR16C5Q8N3Y7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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SDR16C5Q8N3Y7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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SDR16C5Q8N3Y7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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SDR16C5Q8N3Y7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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SDR16C5Q8N3Y7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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SDR16C5Q8N3Y7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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SDR16C5Q8N3Y7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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SDR16C5Q8N3Y7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDR16C5Q8N3Y7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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