Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCN4BQ8IWT1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCN4BQ8IWT1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms