Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC83Q8IWF9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms