Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGDCC3Q8IVU1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms