Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KSR1Q8IVT5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KSR1Q8IVT5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms