Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ8

APRG1, AP20 region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRG1Q8IVJ8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
APRG1Q8IVJ8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APRG1Q8IVJ8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms