Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LCA5Q86VQ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCA5Q86VQ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms