Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ALYREFQ86V81 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ALYREFQ86V81 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALYREFQ86V81 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms