Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRX1Q86UT6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms