Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG4DQ86TL0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG4DQ86TL0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms