Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YTHDF3Q7Z739 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YTHDF3Q7Z739 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms