Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z460

CLASP1, CLIP-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASP1Q7Z460 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CLASP1Q7Z460 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
CLASP1Q7Z460 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLASP1Q7Z460 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms