Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT27Q7Z3Y8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT27Q7Z3Y8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms