Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTF1AQ7RTS3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTF1AQ7RTS3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms