Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHMP1BQ7LBR1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMP1BQ7LBR1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms