Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
H2AFVQ71UI9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
H2AFVQ71UI9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms