Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2R2Q712K3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2R2Q712K3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms