Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PPP1R3FQ6ZSY5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPP1R3FQ6ZSY5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPP1R3FQ6ZSY5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms