Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC73Q6ZRK6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC73Q6ZRK6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC73Q6ZRK6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms