Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLCO4C1Q6ZQN7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms