Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBP6Q6ZN66 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms