Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPTNQ6XPR3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPTNQ6XPR3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms