Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD4Q6W3E5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD4Q6W3E5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD4Q6W3E5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms