Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD4Q6W3E5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD4Q6W3E5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GDPD4Q6W3E5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GDPD4Q6W3E5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms