Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACS1Q6VY07 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PACS1Q6VY07 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS1Q6VY07 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 348.8 ms