Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RANBP10Q6VN20 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RANBP10Q6VN20 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms