Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAF7Q6Q0C0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms