Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJW8

CNST, Consortin, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNSTQ6PJW8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNSTQ6PJW8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNSTQ6PJW8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms