Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDB4

ZNF880, Zinc finger protein 880, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF880Q6PDB4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF880Q6PDB4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF880Q6PDB4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms