Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD74

AAGAB, Alpha- and gamma-adaptin-binding protein p34, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAGABQ6PD74 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AAGABQ6PD74 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AAGABQ6PD74 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms