Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EDC4Q6P2E9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.41
EDC4Q6P2E9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC4Q6P2E9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms