Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC27A4Q6P1M0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms