Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LCN12Q6JVE5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LCN12Q6JVE5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms