Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SFRP4Q6FHJ7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFRP4Q6FHJ7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms