Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLFN13Q68D06 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLFN13Q68D06 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms