Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf57Q5W0N0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf57Q5W0N0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms