Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BROXQ5VW32 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BROXQ5VW32 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms