Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
C9orf135Q5VTT2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C9orf135Q5VTT2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms