Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP9Q5VTM2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP9Q5VTM2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGAP9Q5VTM2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms