Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT97

SYDE2, Rho GTPase-activating protein SYDE2, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE2Q5VT97 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYDE2Q5VT97 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYDE2Q5VT97 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms