Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDGFL1Q5TGJ6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HDGFL1Q5TGJ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HDGFL1Q5TGJ6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms