Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SAMD5Q5TGI4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SAMD5Q5TGI4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms