Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYCP2LQ5T4T6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYCP2LQ5T4T6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCP2LQ5T4T6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms