Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECTD3Q5T447 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECTD3Q5T447 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECTD3Q5T447 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECTD3Q5T447 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECTD3Q5T447 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HECTD3Q5T447 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECTD3Q5T447 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECTD3Q5T447 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECTD3Q5T447 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
HECTD3Q5T447 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HECTD3Q5T447 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HECTD3Q5T447 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms