Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP188Q5SRE5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP188Q5SRE5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NUP188Q5SRE5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms