Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAX1Q5SQQ9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VAX1Q5SQQ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms