Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf38Q5JPI3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.33■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf38Q5JPI3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms