Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P5Q59GN2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P5Q59GN2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms