Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SFT2D3Q587I9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SFT2D3Q587I9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms