Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SGO2Q562F6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SGO2Q562F6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms