Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIPR1Q53HC9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIPR1Q53HC9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIPR1Q53HC9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIPR1Q53HC9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIPR1Q53HC9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIPR1Q53HC9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIPR1Q53HC9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EIPR1Q53HC9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EIPR1Q53HC9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIPR1Q53HC9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIPR1Q53HC9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIPR1Q53HC9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EIPR1Q53HC9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
EIPR1Q53HC9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EIPR1Q53HC9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EIPR1Q53HC9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EIPR1Q53HC9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms